Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MBD2Q9UBB5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MBD2Q9UBB5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms