Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E8

MARCH4, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH4Q9P2E8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MARCH4Q9P2E8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MARCH4Q9P2E8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MARCH4Q9P2E8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms