Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3BP4Q9P0V3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3BP4Q9P0V3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3BP4Q9P0V3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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