Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM5

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP53Q9NZM5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NOP53Q9NZM5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NOP53Q9NZM5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NOP53Q9NZM5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms