Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBP1Q9NZI7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
UBP1Q9NZI7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
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