Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM53CQ9NYF3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM53CQ9NYF3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms