Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SLC5A4Q9NY91 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC5A4Q9NY91 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms