Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE4

SMPD4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD4Q9NXE4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SMPD4Q9NXE4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SMPD4Q9NXE4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SMPD4Q9NXE4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms