Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SDHAF2Q9NX18 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SDHAF2Q9NX18 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms