Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.82■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC33.81■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC33.8■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.79■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SLC52A1Q9NWF4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
SLC52A1Q9NWF4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SLC52A1Q9NWF4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
SLC52A1Q9NWF4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SLC52A1Q9NWF4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SLC52A1Q9NWF4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SLC52A1Q9NWF4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SLC52A1Q9NWF4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SLC52A1Q9NWF4 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SLC52A1Q9NWF4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SLC52A1Q9NWF4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
SLC52A1Q9NWF4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SLC52A1Q9NWF4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SLC52A1Q9NWF4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SLC52A1Q9NWF4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SLC52A1Q9NWF4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SLC52A1Q9NWF4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SLC52A1Q9NWF4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SLC52A1Q9NWF4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SLC52A1Q9NWF4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SLC52A1Q9NWF4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SLC52A1Q9NWF4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SLC52A1Q9NWF4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SLC52A1Q9NWF4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SLC52A1Q9NWF4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SLC52A1Q9NWF4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SLC52A1Q9NWF4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms