Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCM2LQ9NUG4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCM2LQ9NUG4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms