Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJB4Q9NTQ9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GJB4Q9NTQ9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GJB4Q9NTQ9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms