Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT84Q9NSB2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT84Q9NSB2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KRT84Q9NSB2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT84Q9NSB2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT84Q9NSB2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KRT84Q9NSB2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KRT84Q9NSB2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT84Q9NSB2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms