Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RAB6BQ9NRW1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB6BQ9NRW1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB6BQ9NRW1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms