Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 GATD1-208ENST00000528309 510 ntTSL 322.77■■□□□ 1.243e-6■■■■■ 34.8
DROSHAQ9NRR4 SREBF1-214ENST00000486311 473 ntTSL 334.96■■■■□ 3.193e-17■■■■■ 34.8
DROSHAQ9NRR4 SREBF1-212ENST00000478616 882 ntTSL 528.99■■■□□ 2.233e-17■■■■■ 34.8
DROSHAQ9NRR4 DAGLB-205ENST00000454738 1374 ntTSL 234.28■■■■□ 3.082e-10■■■■■ 34.8
DROSHAQ9NRR4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.712e-10■■■■■ 34.8
DROSHAQ9NRR4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.212e-10■■■■■ 34.8
DROSHAQ9NRR4 DAGLB-206ENST00000462934 2589 ntTSL 220.2■□□□□ 0.822e-10■■■■■ 34.8
DROSHAQ9NRR4 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.72e-10■■■■■ 34.8
DROSHAQ9NRR4 HIST1H4C-201ENST00000377803 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.517e-19■■■■■ 34.7
DROSHAQ9NRR4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.322e-10■■■■■ 34.7
DROSHAQ9NRR4 MIR1306-201ENST00000408439 85 ntBASIC14.01□□□□□ -0.172e-19■■■■■ 34.7
DROSHAQ9NRR4 YWHAZ-213ENST00000492736 681 ntTSL 333.55■■■□□ 2.962e-7■■■■■ 34.7
DROSHAQ9NRR4 TANGO2-220ENST00000475446 557 ntTSL 421.85■■□□□ 1.093e-8■■■■■ 34.6
DROSHAQ9NRR4 TANGO2-209ENST00000432198 585 ntTSL 418.48■□□□□ 0.553e-8■■■■■ 34.6
DROSHAQ9NRR4 SGTA-205ENST00000591984 882 ntTSL 217.96■□□□□ 0.474e-6■■■■■ 34.6
DROSHAQ9NRR4 SLC25A25-AS1-201ENST00000418747 6391 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.328e-9■■■■■ 34.5
DROSHAQ9NRR4 ARFRP1-205ENST00000610414 1251 ntTSL 227.54■■■□□ 23e-7■■■■■ 34.4
DROSHAQ9NRR4 ARFRP1-203ENST00000609188 225 ntTSL 526.48■■□□□ 1.833e-7■■■■■ 34.4
DROSHAQ9NRR4 ARFRP1-209ENST00000612772 1375 ntTSL 326.14■■□□□ 1.773e-7■■■■■ 34.4
DROSHAQ9NRR4 ARFRP1-206ENST00000610774 5178 ntTSL 218.35■□□□□ 0.533e-7■■■■■ 34.4
DROSHAQ9NRR4 PLCXD1-206ENST00000430923 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 223.79■■□□□ 1.49e-7■■■■■ 34.4
DROSHAQ9NRR4 PLCXD1-211ENST00000484611 540 ntTSL 423.33■■□□□ 1.339e-7■■■■■ 34.4
DROSHAQ9NRR4 PLCXD1-203ENST00000399012 5287 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.029e-7■■■■■ 34.4
DROSHAQ9NRR4 Z98883.1-201ENST00000409439 916 ntTSL 332.44■■■□□ 2.781e-6■■■■■ 34.4
DROSHAQ9NRR4 SLC26A6-211ENST00000431739 588 ntTSL 322.82■■□□□ 1.246e-9■■■■■ 34.3
DROSHAQ9NRR4 SLC26A6-209ENST00000426599 555 ntTSL 421.87■■□□□ 1.096e-9■■■■■ 34.3
DROSHAQ9NRR4 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.356e-8■■■■■ 34.3
DROSHAQ9NRR4 TEX22-202ENST00000548638 508 ntTSL 518.28■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 34.3
DROSHAQ9NRR4 NUP107-205ENST00000535718 2655 ntTSL 1 (best)15.61■□□□□ 0.099e-13■■■■■ 34.3
DROSHAQ9NRR4 NUP107-201ENST00000229179 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.99e-13■■■■■ 34.3
DROSHAQ9NRR4 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.969e-13■■■■■ 34.3
DROSHAQ9NRR4 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.189e-13■■■■■ 34.3
DROSHAQ9NRR4 CYHR1-208ENST00000528663 5821 ntTSL 1 (best)18.21■□□□□ 0.514e-7■■■■■ 34.3
DROSHAQ9NRR4 CYHR1-211ENST00000533173 6158 ntTSL 1 (best)16.88■□□□□ 0.294e-7■■■■■ 34.3
DROSHAQ9NRR4 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.312e-6■■■■■ 34.2
DROSHAQ9NRR4 RPH3AL-216ENST00000575130 579 ntTSL 426.41■■□□□ 1.821e-6■■■■■ 34.2
DROSHAQ9NRR4 CXXC5-210ENST00000509238 542 ntTSL 225.54■■□□□ 1.683e-6■■■■■ 34.2
DROSHAQ9NRR4 C1orf159-208ENST00000442117 554 ntAPPRIS ALT2 TSL 523.84■■□□□ 1.412e-7■■■■■ 34.2
DROSHAQ9NRR4 COMT-208ENST00000428707 724 ntTSL 321.47■■□□□ 1.034e-10■■■■■ 34.2
DROSHAQ9NRR4 AC011462.1-201ENST00000604424 567 ntTSL 417.77■□□□□ 0.432e-6■■■■■ 34.2
DROSHAQ9NRR4 SH3YL1-221ENST00000477707 581 ntTSL 432.54■■■□□ 2.82e-7■■■■■ 34.1
DROSHAQ9NRR4 SH3YL1-218ENST00000472861 441 ntTSL 313.48□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 34.1
DROSHAQ9NRR4 SH3YL1-214ENST00000465733 551 ntTSL 413.48□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 34.1
DROSHAQ9NRR4 SH3YL1-202ENST00000402632 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 34.1
DROSHAQ9NRR4 SH3YL1-212ENST00000462719 569 ntTSL 49.11□□□□□ -0.952e-7■■■■■ 34.1
DROSHAQ9NRR4 SH3YL1-207ENST00000415368 494 ntTSL 38.61□□□□□ -1.032e-7■■■■■ 34.1
DROSHAQ9NRR4 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC9.5□□□□□ -0.896e-17■■■■■ 34.1
DROSHAQ9NRR4 SLC38A10-206ENST00000540966 896 ntTSL 326.34■■□□□ 1.813e-6■■■■■ 34.1
DROSHAQ9NRR4 SLC38A10-211ENST00000576151 774 ntTSL 224.72■■□□□ 1.553e-6■■■■■ 34.1
DROSHAQ9NRR4 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.491e-6■■■■■ 34.1
DROSHAQ9NRR4 ADCY7-210ENST00000567277 2304 ntTSL 1 (best)21.81■■□□□ 1.081e-6■■■■■ 34.1
DROSHAQ9NRR4 ADCY7-201ENST00000254235 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 34.1
DROSHAQ9NRR4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.322e-6■■■■■ 34.1
DROSHAQ9NRR4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.732e-6■■■■■ 34.1
DROSHAQ9NRR4 BRI3-202ENST00000456357 667 ntTSL 227.17■■□□□ 1.942e-6■■■■■ 34.1
DROSHAQ9NRR4 BRI3-203ENST00000473967 819 ntTSL 523.4■■□□□ 1.342e-6■■■■■ 34.1
DROSHAQ9NRR4 BRI3-206ENST00000491463 567 ntTSL 416.46■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 34.1
DROSHAQ9NRR4 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.81e-6■■■■■ 34
DROSHAQ9NRR4 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.461e-7■■■■■ 33.9
DROSHAQ9NRR4 PISD-204ENST00000422020 1015 ntTSL 517.27■□□□□ 0.351e-7■■■■■ 33.9
DROSHAQ9NRR4 PLCXD1-208ENST00000445062 555 ntTSL 434.09■■■■□ 3.057e-12■■■■■ 33.9
DROSHAQ9NRR4 PLCXD1-205ENST00000429181 469 ntTSL 422.76■■□□□ 1.237e-12■■■■■ 33.9
DROSHAQ9NRR4 PLCXD1-201ENST00000381657 5507 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.087e-12■■■■■ 33.9
DROSHAQ9NRR4 TLE3-210ENST00000557984 478 ntTSL 243.5■■■■■ 4.556e-9■■■■■ 33.9
DROSHAQ9NRR4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.566e-9■■■■■ 33.9
DROSHAQ9NRR4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.426e-9■■■■■ 33.9
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DROSHAQ9NRR4 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.156e-9■■■■■ 33.9
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DROSHAQ9NRR4 TLE3-221ENST00000560525 3647 ntTSL 518.68■□□□□ 0.586e-9■■■■■ 33.9
DROSHAQ9NRR4 TLE3-213ENST00000558379 2304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.566e-9■■■■■ 33.9
DROSHAQ9NRR4 TLE3-220ENST00000559929 3408 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.526e-9■■■■■ 33.9
DROSHAQ9NRR4 TLE3-224ENST00000560996 495 ntTSL 518.16■□□□□ 0.56e-9■■■■■ 33.9
DROSHAQ9NRR4 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.346e-9■■■■■ 33.9
DROSHAQ9NRR4 TLE3-222ENST00000560589 3509 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.076e-9■■■■■ 33.9
DROSHAQ9NRR4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.185e-8■■■■■ 33.9
DROSHAQ9NRR4 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.675e-8■■■■■ 33.9
DROSHAQ9NRR4 CSNK1G2-209ENST00000591752 648 ntTSL 526.34■■□□□ 1.813e-6■■■■■ 33.8
DROSHAQ9NRR4 CTBP2-213ENST00000530930 425 ntTSL 517.45■□□□□ 0.385e-8■■■■■ 33.8
DROSHAQ9NRR4 TSC2-216ENST00000497886 3248 ntTSL 218.73■□□□□ 0.592e-6■■■■■ 33.8
DROSHAQ9NRR4 RPH3AL-212ENST00000573780 531 ntTSL 423.23■■□□□ 1.311e-6■■■■■ 33.7
DROSHAQ9NRR4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.97e-9■■■■■ 33.6
DROSHAQ9NRR4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.87e-9■■■■■ 33.6
DROSHAQ9NRR4 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.925e-8■■■■■ 33.5
DROSHAQ9NRR4 NELFA-210ENST00000455762 1022 ntTSL 529.43■■■□□ 2.34e-7■■■■■ 33.5
DROSHAQ9NRR4 NELFA-201ENST00000333877 2228 ntTSL 227.67■■■□□ 2.024e-7■■■■■ 33.5
DROSHAQ9NRR4 NELFA-207ENST00000431323 888 ntTSL 523.98■■□□□ 1.434e-7■■■■■ 33.5
DROSHAQ9NRR4 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.424e-7■■■■■ 33.5
DROSHAQ9NRR4 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.424e-7■■■■■ 33.5
DROSHAQ9NRR4 NELFA-206ENST00000421397 574 ntTSL 523.07■■□□□ 1.284e-7■■■■■ 33.5
DROSHAQ9NRR4 NELFA-208ENST00000443203 553 ntTSL 421.44■■□□□ 1.024e-7■■■■■ 33.5
DROSHAQ9NRR4 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.784e-7■■■■■ 33.5
DROSHAQ9NRR4 NELFA-204ENST00000411649 561 ntTSL 418.88■□□□□ 0.614e-7■■■■■ 33.5
DROSHAQ9NRR4 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.838e-7■■■■■ 33.5
DROSHAQ9NRR4 SLC7A5-203ENST00000565644 3983 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.038e-7■■■■■ 33.5
DROSHAQ9NRR4 SMPD4-207ENST00000435455 842 ntTSL 524.93■■□□□ 1.584e-10■■■■■ 33.4
DROSHAQ9NRR4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.024e-10■■■■■ 33.4
DROSHAQ9NRR4 SMPD4-204ENST00000430682 820 ntTSL 319.33■□□□□ 0.694e-10■■■■■ 33.4
DROSHAQ9NRR4 SMPD4-217ENST00000473720 555 ntTSL 418.63■□□□□ 0.574e-10■■■■■ 33.4
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