Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLE3Q9NRF9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLE3Q9NRF9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms