Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PFDN4Q9NQP4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PFDN4Q9NQP4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PFDN4Q9NQP4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms