Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYLDQ9NQC7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYLDQ9NQC7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYLDQ9NQC7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
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