Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TIMMDC1Q9NPL8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TIMMDC1Q9NPL8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TIMMDC1Q9NPL8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms