Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PNPLA8Q9NP80 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PNPLA8Q9NP80 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PNPLA8Q9NP80 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms