Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCB6Q9NP58 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ABCB6Q9NP58 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ABCB6Q9NP58 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms