Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CD248Q9HCU0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD248Q9HCU0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms