Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ZNF408Q9H9D4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ZNF408Q9H9D4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.57■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ZNF408Q9H9D4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNF408Q9H9D4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms