Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLMPQ9H6B4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLMPQ9H6B4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLMPQ9H6B4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms