Protein–RNA interactions for Protein: Q9H478

KCNQ1DN, KCNQ1 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1DNQ9H478 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KCNQ1DNQ9H478 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
KCNQ1DNQ9H478 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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