Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SETD2Q9BYW2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SETD2Q9BYW2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SETD2Q9BYW2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms