Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM55Q9BYV6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM55Q9BYV6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms