Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM54Q9BYV2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM54Q9BYV2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM54Q9BYV2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms