Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LSM14BQ9BX40 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LSM14BQ9BX40 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LSM14BQ9BX40 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms