Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SYCP2Q9BX26 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
SYCP2Q9BX26 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
SYCP2Q9BX26 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SYCP2Q9BX26 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SYCP2Q9BX26 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
SYCP2Q9BX26 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SYCP2Q9BX26 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SYCP2Q9BX26 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
SYCP2Q9BX26 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SYCP2Q9BX26 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
SYCP2Q9BX26 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
SYCP2Q9BX26 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
SYCP2Q9BX26 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SYCP2Q9BX26 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SYCP2Q9BX26 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
SYCP2Q9BX26 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
SYCP2Q9BX26 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SYCP2Q9BX26 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SYCP2Q9BX26 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SYCP2Q9BX26 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
SYCP2Q9BX26 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
SYCP2Q9BX26 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SYCP2Q9BX26 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SYCP2Q9BX26 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
SYCP2Q9BX26 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SYCP2Q9BX26 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC35.33■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
SYCP2Q9BX26 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
SYCP2Q9BX26 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
SYCP2Q9BX26 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms