Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPATA9Q9BWV2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPATA9Q9BWV2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPATA9Q9BWV2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPATA9Q9BWV2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SPATA9Q9BWV2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPATA9Q9BWV2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms