Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SSBP4Q9BWG4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SSBP4Q9BWG4 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SSBP4Q9BWG4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms