Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
THUMPD3Q9BV44 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THUMPD3Q9BV44 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
THUMPD3Q9BV44 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms