Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBB6Q9BUF5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TUBB6Q9BUF5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TUBB6Q9BUF5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.8 ms