Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT92

TCHP, Trichoplein keratin filament-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCHPQ9BT92 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCHPQ9BT92 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TCHPQ9BT92 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TCHPQ9BT92 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCHPQ9BT92 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TCHPQ9BT92 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCHPQ9BT92 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCHPQ9BT92 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCHPQ9BT92 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCHPQ9BT92 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TCHPQ9BT92 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCHPQ9BT92 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TCHPQ9BT92 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms