Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC39A3Q9BRY0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC39A3Q9BRY0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC39A3Q9BRY0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms