Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR3

TMEM246, Transmembrane protein 246, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM246Q9BRR3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM246Q9BRR3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM246Q9BRR3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms