Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC77Q9BR77 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC77Q9BR77 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC77Q9BR77 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms