Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TCF25Q9BQ70 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TCF25Q9BQ70 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TCF25Q9BQ70 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms