Protein–RNA interactions for Protein: Q99677

LPAR4, Lysophosphatidic acid receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR4Q99677 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LPAR4Q99677 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPAR4Q99677 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPAR4Q99677 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPAR4Q99677 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPAR4Q99677 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPAR4Q99677 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LPAR4Q99677 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LPAR4Q99677 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LPAR4Q99677 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LPAR4Q99677 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LPAR4Q99677 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LPAR4Q99677 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LPAR4Q99677 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LPAR4Q99677 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LPAR4Q99677 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LPAR4Q99677 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPAR4Q99677 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPAR4Q99677 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPAR4Q99677 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPAR4Q99677 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPAR4Q99677 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPAR4Q99677 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPAR4Q99677 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPAR4Q99677 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPAR4Q99677 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPAR4Q99677 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LPAR4Q99677 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LPAR4Q99677 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LPAR4Q99677 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LPAR4Q99677 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LPAR4Q99677 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LPAR4Q99677 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LPAR4Q99677 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LPAR4Q99677 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 582.1 ms