Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
COPS8Q99627 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COPS8Q99627 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPS8Q99627 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms