Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CSRNP1Q96S65 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CSRNP1Q96S65 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CSRNP1Q96S65 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms