Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TGS1Q96RS0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TGS1Q96RS0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TGS1Q96RS0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TGS1Q96RS0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TGS1Q96RS0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TGS1Q96RS0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TGS1Q96RS0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms