Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MCEEQ96PE7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MCEEQ96PE7 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MCEEQ96PE7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms