Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RUNDC3BQ96NL0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RUNDC3BQ96NL0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RUNDC3BQ96NL0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms