Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NEUROD6Q96NK8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NEUROD6Q96NK8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEUROD6Q96NK8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEUROD6Q96NK8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NEUROD6Q96NK8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEUROD6Q96NK8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEUROD6Q96NK8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEUROD6Q96NK8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NEUROD6Q96NK8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEUROD6Q96NK8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NEUROD6Q96NK8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEUROD6Q96NK8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEUROD6Q96NK8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEUROD6Q96NK8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEUROD6Q96NK8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEUROD6Q96NK8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEUROD6Q96NK8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NEUROD6Q96NK8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEUROD6Q96NK8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEUROD6Q96NK8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NEUROD6Q96NK8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NEUROD6Q96NK8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms