Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT1

RNF145, RING finger protein 145, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF145Q96MT1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RNF145Q96MT1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RNF145Q96MT1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF145Q96MT1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms