Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C9orf72Q96LT7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C9orf72Q96LT7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms