Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALPK3Q96L96 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ALPK3Q96L96 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ALPK3Q96L96 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ALPK3Q96L96 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms