Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK5RAP3Q96JB5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK5RAP3Q96JB5 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDK5RAP3Q96JB5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms